华东交通大学系统工程与密码学研究所，是集产学研为一体的特色科研平台，支撑本科专业信息与计算科学为江西省一流学科，拥有硕士研究生导师4人，招收数据分析、网络信息安全和密码学技术应用方向的研究生。

近5年来完成省部级以上课题30余项，发表论文近50余篇，申请物联网技术和密码技术领域专利获批14项，软件著作权11项。

系统工程与密码学研究所积极探索与业界实力企业合作展开研究和成果转化，与企业和有关部门一起共建华视微电子交通信息安全联合实验室，江西省网络空间安全攻防联合实验室展开产学研，取得丰硕成果。